En las Termas del Guaviyú se registra una temperatura media anual de 19ºC, con gran amplitud térmica entre los meses más cálidos y los más fríos. En verano, el promedio es de 31ºC, con enero como el mes más caluroso; y en invierno las mínimas rondan los 7ºC en promedio y es frecuente que desciendan bajo cero. Las temperaturas en otoño y primavera son agradables, promediando los 20ºC. El mes más lluvioso es marzo (147 milímetros), aunque las lluvias se distribuyen de forma bastante uniforme a lo largo del año.